《皇上保重国语》是一部以清宫为背景的历史动作爱情剧，围绕宫廷中的权力倾轧、民间义士的热血，以及令人惆怅的爱情故事展开。
宝亲王（刘德华）天资聪颖，却生性不羁，令雍正皇帝深感忧虑，不确定他日后能否顺利继承皇位、延续满清基业。为了替宝亲王登基铺路，雍正设计拆散他与孙福如（刘嘉玲）的感情，并册封福如为公主，使她成为宝亲王的皇妹；同时，他又将八旗中最具势力的李荣保之女兰册立为太子妃。尽管两人的姻缘因此被阻断，宝亲王与福如仍暗中来往。
不久，雍正在遇刺后驾崩，宝亲王继位，成为乾隆皇帝。由于乾隆缺乏治国经验，加上苗疆叛乱不断，他不顾一切释放了当年争夺皇位失败的十四皇叔允禵（秦沛）。允禵重新掌握要职后，协助乾隆处理政务，表现得井然有序，却也因此再度燃起夺位野心。他四处散播谣言，引诱乾隆离开京城追查自己的身世，暗中伺机夺取江山。
乾隆微服南下期间，结识了反清秘密会社忠义堂的成员周日清、蛋家妹和赵南星（刘青云），并与他们成为好友。经过一番明察暗访，乾隆终于证实自己确是真正的旗人，也得知允禵正在暗中谋划不轨。
然而，当乾隆的真实身份被揭穿后，忠义堂的反清义士纷纷与他反目成仇；与此同时，他与福如之间的感情也历经波折。即使贵为皇帝，乾隆依然只能面对这段感情带来的无奈与黯然。
