《孖仔孖心肝粤语》讲述一对自幼失散的孪生兄弟王名成（刘青云）与王利就（周星驰）的故事。名成自小跟母亲相依为命，长大后成为电影圈的新进导演，精明能干、敢闯敢拼；利就则被粗鲁豪爽的鲁辉（梁家仁）收养，并改名为鲁细，后来成为一名经纪人，性格开朗直率，且富有正义感。
一次偶然的机会，名成与鲁细重逢并合租同一屋檐下，却始终不知道彼此就是失散多年的亲兄弟。鲁细一直钟情于童年好友方嘉楠（陈秀雯），而嘉楠不仅是名成的下属，也早已喜欢上名成，三人因此陷入一段剪不断理还乱的三角恋情。另一方面，鲁辉结识了嘉楠的阿姨卓龄。卓龄出身高贵、知书识礼，与鲁辉仿佛来自两个世界，但她欣赏鲁辉老实忠诚的性格，两人最终发展出一段浪漫恋情。
兄弟二人后来终于相认，却因性格截然不同而彼此存有隔阂。名成与朋友合伙做生意后遭人欺骗，更因此惹上官非。经历患难的鲁细逐渐明白兄弟情谊的珍贵，遂与众人合力设法营救胞兄。
