《跃迁管理局》讲述了一个专门处理非法时空穿越事件的机构。跃迁管理局秉持历史车轮转，事事不能乱的原则，负责将擅自穿越时空的人带回正确的时间节点，避免历史进程遭到改变。
陈零是管理局的中级执法者，欧阳壹则是年轻的低级办事员，两人既是搭档，也共同执行各项任务。年轻、执着的欧阳壹因陈零拥有仿真智能机器人而受到刺激，又遭到同事嘲笑，心中愤愤不平，最终决定独自执行任务。作为朋友和上司，陈零放心不下，便带着机器人紫芯回到两年前的一天，协助欧阳壹完成带回跃迁者的任务。
两人起初顺利带回了非法跃迁者李川，却发现李川随后再次回到了两年前，任务也因此莫名失败。无奈之下，陈零和欧阳壹只能一次次返回过去，追查事件背后的真相。与此同时，李川已经掌握了自主控制穿越的能力。随着追踪不断深入，陈零和欧阳壹也在一次次时空往返中，逐渐揭开了事情的谜底。
