《非常小特务3》中，聪明勇敢的卡门（阿丽夏·潘娜维加 Alexa PenaVega 饰）陷入了前所未有的危机：她的精神被疯狂的玩具制造商（西尔维斯特·史泰龙 Sylvester Stallone 饰）困在了对方亲手打造的虚拟游戏世界里。为了救出姐姐，朱尼（达里尔·沙巴拉 Daryl Sabara 饰）勇敢地加入了一支专门攻略这款游戏的测试小组，与一群同样身手不凡的孩子并肩作战。进入虚拟世界后，他不仅要接连挑战各种古怪而艰难的关卡，还必须时刻提防玩具制造商分裂出的五种截然不同的人格。在祖父（里卡多·蒙特尔班 Ricardo Montalban 饰）和朋友们的帮助下，朱尼能否击败强大的对手，成功救回卡门？
