《黑匣子》的故事发生在一个普通的北方家庭。男主角杨宝坤是工厂厂长杨富贵的儿子，正值青春期的他和许多同龄孩子一样，抽烟、喝酒，整日游手好闲。他爱上了喜欢跳舞的马兰，并梦想拥有一辆摩托车，好每天骑车送她回家。
与此同时，杨宝坤的母亲和妹妹意外撞见杨富贵与工厂女工赵艳红在床上的一幕，而杨富贵经营的工厂也正陷入危机。面对家庭的变故、父亲的背叛以及自己的感情，杨宝坤将如何选择人生？身为家庭主妇的母亲又会怎样面对家庭与爱情？杨富贵又该如何处理妻子和情人之间的关系？一连串难题摆在这个真实而平凡的家庭面前，他们最终将作出怎样的抉择？
