《特工总裁校花宠妻》的故事发生在东欧某国。任浩铭是一名华裔青年，凭借庞大的资产成为举世瞩目的商界巨子。尽管家财万贯，他始终热心公益，而不为人知的是，他还拥有特别调查事务局特工这一特殊身份。阮清恬则是皇家艺术学院的舞蹈系学生。一次偶然的躲避中，她为了摆脱同学任浩杰持续不断的追求与纠缠，误打误撞上了任浩铭的车，两人因此相识，阮清恬也逐渐对任浩铭产生了好感。
任浩杰并不知道哥哥与阮清恬已经相识，仍旧执着地追求着她。直到任浩铭前往艺术学院寻找弟弟时，意外发现阮清恬也是那里的一名学生，这才明白弟弟一直念念不忘的女孩，正是自己心仪之人。随着相处加深，阮清恬也察觉到自己已陷入这对兄弟共同编织的情感纠葛之中，内心备受煎熬。就在三人的关系愈发复杂之际，任浩铭突然发现，阮清恬的身世竟与一桩跨国犯罪案件存在密切关联。
