深夜，一座神秘工厂突发命案，一名员工惨死现场。由于现场线索诡异，众人纷纷传言凶手是一只不知名的异兽，原本普通的案件也因此蒙上了神秘色彩。被害人的家属随后委托国际知名灵异侦探社展开调查，然而侦探社接连受到假线索误导，最终将厂长认定为凶手。就在案情即将明朗之际，厂长却在一个极不合时宜的时间自杀，令真相变得更加复杂。
厂长死后，他的女儿光子将侦探社社长何生告上法庭，侦探社也因此陷入严重的信誉危机。察觉到事件远比表面复杂，何生派出保镖风泽和电脑高手小弥前往涉事工厂调查。经过追查，他们发现厂长其实死于谋杀，并将怀疑对象锁定为工厂技术顾问长谷川。进一步调查显示，长谷川的真实身份竟是日本通缉犯，而且还与流浪汉失踪案存在关联。与此同时，光子逐渐放下对何生的偏见，决定与他联手查明父亲死亡的真相。
何生一行人深入工厂内部，终于揭开了这里的真正面目：工厂实际上是一座大型生物实验室，背后还牵涉一个神秘的国际组织，异兽杀人的传闻也似乎即将找到答案。然而就在真相浮出水面之际，长谷川突然倒戈，声称真正的幕后主使另有其人。究竟是什么原因让长谷川受人指使？那个暗中操纵一切、唯恐天下不乱的“神秘人”到底是谁？
