《济公之降龙有悔》讲述了济公以大爱感化灾星转世、拯救苍生的故事。
十八年前，雷电交加之夜，姚小蝶横空出生。她的降临间接引发了全村大火，更导致亲生父亲葬身火海。自此，所有人都认为小蝶是不祥与灾难的象征。天庭得知此事后，查出她正是八百年才转世一次的灾星。为了避免她给凡间带来灾祸，天庭决定派使者取她性命。
济公得知此事后出手阻止，并在小蝶身上施下封印，使任何人，包括天庭神仙，都无法夺走她的性命。在济公看来，小蝶既然能够降生便是天意，只要等她十八年后灵性成熟，便有机会将她救赎。
十八年后，济公与众仙一同来到小蝶身边。众仙认定她是灾难化身，为了天下苍生必须将她消灭；济公却坚持用慈悲与大爱将她渡化。双方约定七日为期，若济公无法在七天之内改变小蝶的命运，众仙便会将她除掉。
调查之下，济公发现小蝶体内寄居着数个元神，而这些元神竟是她前世轮回中的不同身份。由于他们生前都含恨而终，强烈的怨念一直留在小蝶体内。济公尝试将元神逐一引出并加以超渡，先后成功化解了三个元神，小蝶的状况也逐渐好转。
然而期限将至，最后一个元神始终不肯现身。众仙也查明，这个隐藏在小蝶体内的元神，正是千年才转世一次的灾难之王。一旦他出现，凡间将面临前所未有的浩劫。在众仙步步紧逼、小蝶命悬一线之际，济公能否凭借无私的大爱，最终感化这位千年灾难魔王？
