《暗色天堂》讲述了杜天明（张学友饰）的故事。作为国际慈善机构香港分部的总干事，杜天明不仅社会地位崇高，还是一名虔诚的基督教徒。他口才出众，经常在教堂传教，深受信徒爱戴与信赖。
一天，机构迎来年轻女助理蜜雪儿（林嘉欣饰）。她逐渐被杜天明成熟稳重的气质吸引，两人的关系也在相处中不断拉近。然而，面对彼此悬殊的身份与地位，杜天明始终克制着自己的情感，不敢越过界限。
不久后，杜天明即将调往英国，担任亚洲区总干事。临行之前，他决定与蜜雪儿共进一顿“最后的晚餐”。没想到，当晚的气氛逐渐变得暧昧，在车内，杜天明最终没能抵挡住人性的诱惑，做出了一个彻底改变自己一生的决定。
