《无仁义之战4：顶上作战》以昭和38年的广岛为背景。明石组系与神和会系之间的争斗不断升级，无辜市民也接连遭到波及。面对舆论和民众的巨大压力，警方调动全部力量，展开名为“顶上作战”的扫黑行动。
为了扩充势力，广能昌三（菅原文太 饰）设法说服中立派义西会会长冈岛友次（小池朝雄 饰）倒向明石一派。然而，广能组干部河西清（八名信夫 饰）遭到刺杀，双方冲突进一步扩大，袭击事件频繁发生。明石组的岩井（梅宫辰夫 饰）企图利用河西的葬礼召集西日本同盟，趁机突袭山守组，却因打本（加藤武 饰）泄露计划而功亏一篑。山守义雄（金子信雄 饰）随后向警方告发，导致广能被捕。
此后，广能组成员接连遇袭，冈岛也遭人刺杀，明石一派逐渐陷入不利局面。就在此时，义西会干部藤田正一（松方弘树 饰）接替空缺，与山守组少壮派武田明（小林旭 饰）展开新一轮较量。与此同时，警方针对各方黑帮干部的全面行动也正式展开。
