《我们无法一起学习第一季》的主人公唯我成幸（逢坂良太 配音）看似只是个平凡的青年，却凭借各门学科都十分出色的成绩脱颖而出。为了获得学校提供的特殊VIP推荐名额，免除考试与学费，他主动申请担任教育指导员，负责帮助同学们学习。
成幸需要辅导的对象，是校园中备受瞩目的三位传奇少女：被誉为“文学之森的睡美人”的千金大小姐古桥文乃（白石晴香 配音）、被称为“机关精巧的拇指姑娘”的理科天才绪方理珠（富田美忧 配音），以及游泳部的王牌选手、拥有“白银的漆黑人鱼公主”之称的武元润香（铃代纱弓 配音）。然而，三人虽然各自在某一领域展现出惊人的才能，却也在自己不擅长的科目上表现得出人意料。原以为轻松的辅导工作，就这样变成了一场充满意外与挑战的学习生活。
