《S·A特优生》讲述了华园光（后藤邑子 配音）的故事。她从小在热爱职业摔跤的父亲培养下长大，练就了一身出色的摔跤本领，几乎从未遇到过敌手，直到泷岛彗（福山润 配音）出现在她面前。为了战胜彗，光说服父亲考入白选馆学园高校，并成功进入汇聚全校顶尖精英的S·A班。
S·A即Special A，是只有全年级前七名学生才有资格进入的特优班。然而即使身处其中，光依旧无法超越全年级第一的彗，还总被他调侃为“永远的第二名”。班上其他成员同样各有所长：排名第三和第四的天才音乐家双胞胎山本纯（代永翼 配音）与山本芽（高垣彩阳 配音）、身为学院理事长之子的第五名狩野宙（下野紘 配音）、航空公司社长千金兼第六名的东堂明（生天目仁美 配音），以及体育用品公司社长之子、排名第七的辻龙（堀江一真 配音）。为了实现击败彗的目标，光一次又一次向他发起挑战，而两人的故事也仍在继续。
