未知生物讲述了南方烟波岛上一连串离奇怪案。岛上居民接连神秘失踪之际，一名短发少女（付小仙 饰）突然来到小镇，而她的出现似乎与失踪事件有着密切联系。为了寻找失踪的好友游尚杰（祁宋 饰），小镇高中生付君浩（吴幸键 饰）和张宇轩（王成 饰）带着这名来历不明的少女展开调查，试图一步步揭开背后的真相。
与此同时，小镇高中女老师沙拉（余心恬 饰）因亲生哥哥失踪，也与岛上的富二代、自己的欢喜冤家苏民绪（麻家铭 饰）组成调查小队，追查突然现身的神秘黑衣人团伙。岛上各处不断出现的黑色粘液究竟是什么？高中生游尚杰又被什么东西带走？海潮街的枯井里为何会传出诡异声响？黑衣人口中的“博士”究竟指向谁？随着一个个谜团浮出水面，一场足以威胁全岛居民的巨大危机正在悄然逼近，而善良的人们对此仍毫不知情。
