《何文秀传奇》讲述了明世宗年间，吏部何尚书遭严嵩诬陷，最终满门抄斩。其子何文秀在逃亡途中，夜闯严嵩党羽王家后花园，幸得王府千金王兰英出手相救。王兰英不惜背叛亲人，随何文秀一同逃走，两人在途中结为夫妻，并返回故乡海宁投亲。
不料，何文秀的堂叔、原任海宁知县的何家亲属也受到牵连，被发配充军。何文秀投亲无门，只得靠替人书写字画度日。当地豪门恶少张堂觊觎王兰英的美貌，设法将夫妻二人骗入府中，并以何文秀是朝廷逃犯相威胁，逼他休妻，让王兰英改嫁自己。何文秀严词拒绝后，善良的丫鬟梅香暗中放走王兰英，却遭张堂杀害，张堂还将罪责栽赃给何文秀。随后，何文秀又被诬陷为逃犯，并被指控奸杀张府婢女，最终押入县衙死牢。
海宁王知县得知严嵩在朝中失势、获罪下狱，预感朝廷即将发生变故，也担心何尚书一案平反后牵连自身，于是与张堂合谋，企图杀人灭口。幸亏狱头王义知晓内情且为人仗义，与何文秀合力焚毁监狱，连夜逃出。张堂得知王兰英的下落后，带人前往杨妈妈的茶馆搜查，却被身怀武艺的杨妈妈打得狼狈逃窜。为确保王兰英安全，杨妈妈只得连夜带她离开。
三年后，严嵩死于狱中，朝廷开始选贤任能、励精图治。何文秀赴试高中，恰逢父亲一案得到昭雪，遂被封为江南巡按。他微服返回海宁，暗中寻找王兰英，并乔装成算命先生代人写状。最终，何文秀升堂审判张堂和王知县，为百姓铲除祸害，也与王兰英历经磨难后夫妻团圆。
