《持有秘密的少年们》是一部情色悬疑片，描绘了变成“夜行”的少年少女们所面临的残酷命运。所谓“夜行”，是一种会袭击人类并吸食血液的存在。围绕他们展开的故事交织着争夺、背叛、嫉妒、欺凌与出轨，展现出错综复杂的人物关系。
主人公光石玲矢变成夜行后，极力隐藏这一事实，并遇见了一群生活在夜色中的少年。为了躲避“夜行狩猎”的暴力，也为了抵抗对人类血液的强烈渴望，他们聚集在一家livehouse，组建了名为“404 not found”的乐队，沉浸于音乐之中。玲矢一边与自身的命运苦苦抗争，一边逐渐被卷入更深的谜团，而残酷的真相也随之慢慢浮出水面。
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