《新少林五祖》讲述清末年间的武林故事。当时武风盛行，武当派奇才白眉道人为扬名立万，自创阴狠毒辣的武功。武当掌门得知此事后，将他逐出师门。白眉来到广州另立门户，开馆授徒，并创立了白眉派。
随后，白眉前往少林寺挑战至善禅师，但至善对他的挑衅置之不理。至善的师兄仰山看不惯白眉的所作所为，私下出面应战，却惨遭败北。此时，痴迷武术的洪熙官独自来到少林寺寻找至善，希望拜师学艺，却遭到拒绝。两人也因此相识，至善听取洪熙官的意见后下山，开始视察武林状况，师徒二人由此踏入江湖。
至善逐渐察觉，世人对武学真谛缺乏真正理解，于是成立精武体育会，倡导体育精神，希望纠正武林中的不正之风。在武术大赛中，松等人认真听取至善的分析。
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