《地下忍者》改编自花泽健吾的同名漫画。日本忍者曾经盛极一时，却在战后被GHQ解散组织，从此淡出世人视野。实际上，他们一直潜伏于世界各地的各类机构之中，至今仍在暗中行动，据说总人数约有20万人。然而，身处基层的忍者往往难以找到工作。云隐九郎（山崎贤人 饰）便是其中一员，作为忍者组织“NIN”最底层的下忍，他终日无所事事，生活状态几乎与啃老族无异。某天，百无聊赖的九郎突然接到一项重大“忍务”——调查一个自战后70多年来便潜伏于地下的神秘组织，而对方的名字正是“地下忍者”。一场融合忍术、智谋与尖端科技的前所未有的战斗，就此拉开序幕。
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