百妖谱第一季讲述了鬼医桃夭行走江湖的故事。她医术高明，善恶难辨，手持金铃，能令妖怪闻风丧胆；作为桃都鬼医，她只为妖怪诊治，从不医治人类。桃夭带着磨牙小和尚云游四方，沿途为各路妖怪解决疑难杂症，也帮助受到牵连的人类排忧解难。磨牙的跟班狐狸滚滚，以及桃夭的老邻居蛇妖柳公子，也先后加入队伍。面对妖怪横行、危机四伏却又充满眷恋的人间，桃夭、磨牙、滚滚和柳公子共同踏上探寻与救治之旅。四人之间的关系始终若隐若现，层层谜团与稀奇古怪的问题，也等待着这个小团队逐一解决，而他们所经历的，不过是世间百妖故事的冰山一角。
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