珍爱泉源交织讲述了三个跨越千年的故事。1500年，大将军托马斯（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）奉皇后伊莎贝拉（蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰）之命前往新大陆，寻找传说中能够赋予人永生的生命之树。历经重重艰险后，他终于抵达一处辉煌而隐秘的所在，见到了终生难忘的奇异景象。
2000年，脑癌专家汤米（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）为了挽救身患脑癌的妻子丽兹（蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰），四处寻找有效的治疗方法。研究小组从南美洲丛林带回一株奇异的树种标本，并从中提炼药物进行黑猩猩实验，没想到竟奇迹般地取得了效果。
2500年，汤姆乘坐由思想控制的透明圆球飞船，穿梭在浩瀚宇宙之间。陪伴他的，只有一棵濒临死亡的古树，而他始终无法忘却与丽兹共度的记忆。跨越千年的时空流转，他一直苦苦追寻的，或许正是生命最深层的真谛。
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