雷霆掃穴講述飛虎隊總督察張鐵柱的故事。他是令匪徒聞風喪膽的罪惡煞星，為了打擊以小島作掩護的軍火走私集團，特別策劃雷霆掃穴行動，誓要將整個黑道集團一網打盡。賀龍人稱凍肉人，手下控制著一批殺手，直接或間接犯下多宗嚴重罪行，因此成為這次行動的頭號目標。行動展開後，張鐵柱奉命與反黑組高級督察汪志強合作。兩人同為警隊精英，聯手之下令賀龍節節敗退、倉皇逃亡。然而在一次追捕行動中，汪志強槍殺了賀龍的手下小黑，小黑的弟弟得知消息後，誓要為兄長報仇。
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