《便利店兄弟 柔情便利店门司港小金村门市》以九州柔情便利店门司港小金村门市为故事舞台。魅力十足的店长志波三彦把店铺经营得仿佛偶像现场，甚至吸引顾客和公寓居民成立后援会。兼职店员光莉出于好奇，开始创作关于店长的网络漫画，没想到作品意外走红。与此同时，她发现一名经常大量购买便当的神秘男子。一次突发事件揭开了两人的真实关系——这名看似狂野的男子竟是店长志波三彦的兄弟。随着兄弟二人的出现，店员与顾客各自的烦恼也在时尚感与热血交织的氛围中逐一得到解决，一段充满温情、喜剧色彩和群像悬念的便利店故事就此展开。
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