古惑仔激情篇之洪兴大飞哥讲述了洪兴大飞（黄秋生 饰）手下没牙佬的女儿阿May，与东星大咪手下的皇帝（黎骏 饰）相恋的故事。两位大佬因此坐下来谈判，却因大飞的嚣张态度令皇帝的小弟善仔等人心生不满。第二天，善仔一行人闯入大飞经营的桑拿馆闹事，最终反被大飞的人狠狠教训。
一天，大飞前去探望身患癌症、时日无多的前女友阿玲，意外得知自己还有一个17岁的儿子，而这个儿子正是善仔。尽管亲子鉴定证实两人确实存在父子关系，但大飞和善仔都难以接受这一事实。
与此同时，东星社准备与云南毒贩进行毒品交易，皇帝亲自负责安排，并派善仔等人前往。没想到善仔暗中吞下毒品，还将罪责嫁祸给大飞。面对兄弟情义与父子亲情，善仔不得不作出一个充满危险的抉择。
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