井冈山1993讲述了1927年秋收起义失败后，毛泽东率工农革命军第一军第一师向南转移的历程。部队途中遭到敌军袭击，损失惨重，领导内部也因部队去向问题产生了激烈分歧。最终，毛泽东的意见得到大多数同志支持，部队继续南行。抵达永新县三湾村后，毛泽东及时整编残部，确立了党对军队的绝对领导。
为了建立巩固的革命根据地、壮大革命力量，毛泽东提出争取袁文才、王佐等地方武装。在这一问题上，他再次与余洒度等第一批黄埔军校毕业的军官发生分歧。余洒度等人以赴省汇报为名离开井冈山，而毛泽东则以诚相待，逐渐取得袁文才的信任，部队得以进驻茅坪，毛泽东也在那里遇到了贺子珍。随后，他一边继续争取王佐，一边派何长工前往省委汇报，并寻找南昌起义失败后南下的朱德部队。王佐很快接受改编，加入工农革命军，队伍实力得到增强，并在首次作战中一举攻下新城。
然而，省特派员周修明要求部队改道支援湖南暴动，且错误传达省委指示，开除了毛泽东的党籍。无奈之下，毛泽东一面前往中央申诉，一面出兵湖南，结果部队遭遇惨败，井冈山后方根据地也随之失守。毛泽东满怀愤懑地返回井冈山，经过一番浴血奋战，他与朱德率领的部队终于在1928年4月28日于井冈山胜利会师。
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