B 侦探的故事紧接着《C 侦探》展开。阿探（郭富城 饰）凭借出色的破案能力赢得了认可，好友风泽（廖启智 饰）也因此觉得脸上有光。然而，风泽在警局中的处境依旧不如意，后来更被调到以争功著称的卢长官（谭耀文 饰）手下。就在他调任不久后，辖区内接连发生凶案，四名死者彼此毫无关联，而凶手却在每个现场都留下了刻意安排的线索。阿探出手协助风泽办案，顶着卢长官的冷眼，提出了多种关于凶手身份的推测，最终初步将目标锁定为一名精神分裂症患者。调查过程中，嫌疑人梁伟业（张兆辉 饰）病发并挟持人质，阿探巧施计谋将他制服，却发现梁伟业并不是真正的凶手。没过多久，阿探遭到卢长官手下的恐吓，风泽也被人撞伤。怒火中烧的阿探找上卢长官，却得知这名嫌疑人的攻击性远远超出了他的想象……
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