《黑之契约者2：流星的双子》讲述了十年前东京出现神秘领域地狱门的故事。凡是从地狱门中走出的人，都会获得能够夺取他人性命的特殊超能力，同时也像恶魔一样失去梦与心，因此被称为契约者。美国CIA、英国MI6、日本警视厅以及神秘组织潘多拉，纷纷对地狱门展开调查与研究，甚至试图消灭所有契约者；知晓真相的契约者们则联合起来展开对抗。
被称为黑之死神的黑（木内秀信 配音）奉命执行组织交代的任务，同时始终没有放弃寻找五年前失踪的妹妹。一次行动中，他偶然遇见昔日恋人琥珀（川上伦子 配音），却发现对方似乎隐藏着不为人知的秘密。黑能否揭开琥珀真正的身份？他和失踪多年的妹妹是否还有重逢的机会？人类与契约者的命运，又将走向怎样的结局？
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