《乔瓦尼之岛》讲述了1945年夏天发生在北方色丹岛上的故事。第二次世界大战的阴影刚刚从世界上空散去，岛上却未能迎来真正的安宁。炮火过后不久，苏联战舰和军队抵达这里，日本岛民面对这突如其来的变化，既不安又惶惑。
濑能家的两个孩子，10岁的淳平和7岁的宽太，亲眼见证了时代的剧烈转折。最初的残酷逐渐平息，随着苏联家属来到岛上，原本彼此戒备的人们之间，也悄然萌生出和平与友谊的可能。音乐让苏日两国的孩子走到一起，他们唱歌、玩耍，淳平和宽太也因为心爱的玩具蒸汽火车，与住在家隔壁的女孩塔尼娅建立了深厚情谊。然而，这段来之不易的友情最终因某起事件而破裂。
在时代、民族、国家与政治交织而成的洪流中，孩子们被迫承受了远超年龄的离别与伤痛，而那些最初刻下的伤痕，也注定永远不会褪去。
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