反叛的鲁路修剧场版3：皇道在总集篇的基础上调整了部分剧情，并承接次年2月上映的复活新作。世界最大的国家神圣布里塔尼亚帝国终于与黑之骑士团正面交锋，而这一切正是鲁路修以面具男ZERO的身份布下的棋局。只是，唯一超出他预料的变数，便是妹妹娜娜莉的出现。
与此同时，第2皇子修奈泽尔与黑之骑士团接触，并向扇、藤堂等人揭露了足以动摇他们对ZERO信任的秘密。随着战火不断升级，众人的愤怒、悲伤、执着与愿望也被一并卷入其中。为了未来，他们此刻究竟应该做些什么？这便是“零之镇魂曲”——埋葬那个充满憎恨的旧时代，为新时代祈愿。鲁路修与朱雀的故事，也将迎来冲击性的明日。
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