《闪电十一人 猎户座的刻印》讲述了日本足球代表队“闪电日本”正式成立，最强十一人踏上世界舞台的故事。稲森明日人、灰崎凌兵和野坂悠马等来自不同学校的精英选手齐聚一堂，此外，曾与海外日本籍选手并肩比赛的新手一星充也加入了队伍。通往世界的大门终于开启，日本国家足球队即将扬帆出征。
然而，等待着他们的试炼远远超出预期。神秘组织“俄里翁的使徒”在背后操纵着一切，策略、背叛与冲突接踵而至。备受期待的世界足球大赛FFI（国际级水平明日之星足球大赛）正式拉开帷幕，闪电日本将向世界发起挑战。
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