《假面骑士月骑》讲述了一个围绕小提琴展开的父子故事。
本作的敌人是以生命能量为食、依靠吞噬生命维生的吸血鬼族Fungaia。与它们战斗的，是在父亲留下的工坊中制作小提琴的红渡。借助腰带的力量，渡能够变身为假面骑士牙，但他为何拥有变身的能力，又为何必须投身战斗，至今仍是谜团。
事实上，与Fungaia交战的并不只有渡一人。22年前，渡的父亲红音也便已经开始与肆虐的Fungaia战斗。故事将渡所处的现代，与22年前那个年轻的音也结婚、生下渡之前的时代紧密交织在一起。
当年未能被音也彻底消灭的Fungaia不断繁衍，如今再次出现在现代日本。渡化身假面骑士牙，将它们逐一击倒，也由此连接起过去与现在。然而，世间存在的形态并不只有肉眼能够看见的样子。生活在不同时代的人们，他们的命运究竟会以怎样的方式交汇？Fungaia为何会威胁到人类的生存？身处这场命运漩涡中的渡与音也，又背负着怎样的宿命？
来自不同时代、拥有不同人生的人们，就这样共同推动着故事的发展。真正了解这两个时代的人，只有岛和木户师傅两人。岛曾将Fungaia Hunter组织化，而木户师傅则从22年前开始经营咖啡店「Coffee Mall Damour」。穿梭于两个时代的人们，以及左右他们命运的关键，或许正是这两个人，还有那把由父亲留下的小提琴。
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