《空中杀手》中，战斗机飞行员函南优一（加濑亮配音）来到基地报到，迎接他的既是陌生的生活环境，也是熟悉的飞行战斗。在基地里，他结识了性格各异的战友，以及沉默寡言、严肃冷峻的长官草薙水素（菊地凛子配音）。函南优一接手了一架新战斗机，但每当他打听这架飞机的前任驾驶员时，战友们总是闭口不谈。随着关注不断加深，他逐渐得知前任驾驶员已经去世，而这起事件似乎与草薙水素有着密切联系。调查一步步深入后，函南优一开始触及一个令人震惊的真相，就连自己每天与敌人展开的战斗，也仿佛隐藏着某种尚未被他察觉的意义。
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